نفى المرشح لرئاسة اتحاد كرة القدم  السعودي في انتخاباته الأخيرة في ديسمبر/كانون الاول 2016،  خالد بن معمر، ما تردد عبر بعض وسائل الإعلام عن توجهه للاتحاد الدولي لكرة القدم لتقديم شكوى ضد مخالفات لجنة الانتخابات.وقال بن معمر: "أنفي ما ذُكر جملة وتفصيلًا، وهذا نابع من حرصي الدائم على وحدة الصف، والمشاركة في طرح الحلول الودية والقانونية، واستشعار المسؤولية تجاه ما تعيشه الأندية واتحاد القدم من أزمات ومعوقات، سواء بتراكم الديون أو تزايد العقوبات الصادرة ضدها نتيجة للخلل المهني في تركيبة اللجان ودورها وتهميش الجمعيات العمومية، وهو الأمر الذي يؤكد حاجة المنظومة الرياضية الماسة لترسيخ الوعي القانوني وتفعيل الشفافية، ومنها اتخاذ الإجراءات التي طالبت بخلالها بفحص مخالفات لجنة الانتخابات، وما شابها وما نتج عنها".

وطالب المرشح  السابق بتضافر الجهود لتحقيق العمل المؤسسي وبناء بيئة كرة قدم سليمة، والسير على الطريق الصحيح للرقي بالكرة السعودية في ضوء ما تلقاه من رعاية ودعم حكومي، وما تملكه من كفاءات ومواهب كروية، واستطرد بقوله: "نحن اليوم لدينا الاستحقاق الأهم بمؤازرة المنتخب أمام منتخب تايلاند، في التصفيات النهائية لكأس العالم والبحث عن تحقيق الفوز من أجل الحفاظ على الصدارة، باعتبارها المباراة الأهم في مشوار التصفيات المؤهلة للمونديال العالمي".